等待期发病不理赔
市民在首次投保费用型医疗险时，通常都有一个等待期。如有的产品条款中明确约定，被保险人因意外伤害或合同生效60日内(续保除外)，因疾病在指定医院住院所支付的住院医疗费用，本公司不承担保险责任。这也就意味着，在保险刚刚生效的前60天内，被保险人即使因疾病住院治疗产生各项费用，保险公司也不会给报。而除了60天的等待期外，还有些产品的等待期要长达3个月。不过，续保则无等待期。
实际理赔额小于保额
大多数保户能从费用型医疗险获得的实际赔偿金额，一般都小于投保的保额。如有保险产品条款约定，住院费保险金按被保险人实际住院床位费用给付，每日给付限额为20元，每次住院最长给付天数为180天。这也就相当于，每次住院费保障上限为3600元。当保户获得的各项累计给付保险金达到保险金额全数时，合同即行终止。并且，这类产品一般还设定免赔额，如，该产品对住院杂项费及手术费的赔付，需保户先自付400元，保险公司仅对超过400元的部分承担责任。
多次投保不重复理赔
比如说投保人投保了两份费用型医疗保险，发生事故后先到其中一家保险公司理赔，保险公司会在所有的费用单据上盖章，并在医院开出的总费用单上注明公司的名称、赔付的具体金额以及日期。当投保人拿着已理赔过的单据去第二家保险公司理赔时，这家保险公司会根据具体合同条款，把实际医疗费用扣除已经赔付的金额后给付。
特别护理无赔付
虽然费用型医疗保险的主要功能是报销被保险人的住院医疗费用，但并非被保险人因各种原因住院、使用各类药品的费用都予报销。如有些费用型保险产品规定，因一般身体检查、疗养、康复治疗、特别护理或静养，致使被保险人支付的住院医疗费用，公司不负给付保险金责任。而除上述情形外，对于社会医疗保险管理部门规定应自费的药品、检查、手术、治疗及其他项目、未经卫生管理部门批准的医疗收费项目，保险公司同样不予报销。
